Elektroforeza u poliakrilamidnom gelu (PAGE) ima širok raspon primjenjive vrijednosti u biološkim i biokemijskim istraživanjima, uglavnom u sljedećim aspektima:
Razdvajanje i identifikacija proteina : PAGE razdvaja uzorke proteina djelovanjem električnog polja, odvaja ih prema veličini i razlici naboja proteina, a zatim ih analizira. Ova se metoda može koristiti za odvajanje i identifikaciju različitih komponenti proteina u uzorcima proteina i analizu molekularne težine i stanja naboja proteina.
Analiza molekularne težine proteina i stanja naboja : PAGE može analizirati molekularnu težinu i stanje naboja proteina prema njihovoj brzini migracije u električnom polju. Veliki molekularni proteini migriraju sporo, mali molekularni proteini migriraju brzo, pozitivno nabijeni proteini migriraju na katodu, a negativno nabijeni proteini migriraju na anodu.
Detekcija čistoće i sadržaja proteina : PAGE u kombinaciji s bojenjem ili drugim metodama detekcije može vizualizirati trake proteina i izvesti kvantitativnu analizu. Ova se metoda može koristiti za određivanje čistoće i sadržaja proteina.
Daljnja identifikacija i kvantifikacija u kombinaciji s drugim analitičkim metodama : PAGE se može kombinirati s drugim analitičkim metodama kao što je spektrometrija mase za daljnju identifikaciju i kvantificiranje odvojenih proteina. To PAGE čini vrijednim u istraživanju proteomike.
Primjene SDS-PAGE i Native-PAGE: Ovisno o svrsi analize, PAGE se može izvoditi pod denaturirajućim ili ne-denaturirajućim uvjetima. SDS-PAGE eliminira strukturne učinke i učinke naboja proteina tretmanom denaturacije, dopuštajući njihovo odvajanje samo na temelju molekularne težine; dok Native-PAGE zadržava strukturu višeg-reda proteina i uglavnom se koristi za analizu prirodnog stanja i interakcija proteina

